Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms