Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP08

HMX1, Homeobox protein HMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX1Q9NP08 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HMX1Q9NP08 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HMX1Q9NP08 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HMX1Q9NP08 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMX1Q9NP08 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMX1Q9NP08 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMX1Q9NP08 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMX1Q9NP08 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMX1Q9NP08 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMX1Q9NP08 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMX1Q9NP08 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HMX1Q9NP08 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMX1Q9NP08 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMX1Q9NP08 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMX1Q9NP08 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMX1Q9NP08 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMX1Q9NP08 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMX1Q9NP08 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMX1Q9NP08 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMX1Q9NP08 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HMX1Q9NP08 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMX1Q9NP08 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMX1Q9NP08 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms