Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCG8

CWC22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC22Q9HCG8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CWC22Q9HCG8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CWC22Q9HCG8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CWC22Q9HCG8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CWC22Q9HCG8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC22Q9HCG8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC22Q9HCG8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC22Q9HCG8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC22Q9HCG8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC22Q9HCG8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC22Q9HCG8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC22Q9HCG8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC22Q9HCG8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC22Q9HCG8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC22Q9HCG8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC22Q9HCG8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC22Q9HCG8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC22Q9HCG8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms