Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCF6

TRPM3, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM3Q9HCF6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRPM3Q9HCF6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TRPM3Q9HCF6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRPM3Q9HCF6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRPM3Q9HCF6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TRPM3Q9HCF6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRPM3Q9HCF6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRPM3Q9HCF6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRPM3Q9HCF6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRPM3Q9HCF6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRPM3Q9HCF6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms