Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms