Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
POLR2J2Q9GZM3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms