Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BHLHE41Q9C0J9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms