Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP1Q9C000 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.83■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms