Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms