Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms