Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms