Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB7

SPATA16, Spermatogenesis-associated protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA16Q9BXB7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPATA16Q9BXB7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms