Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms