Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf50Q9BV19 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
C1orf50Q9BV19 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
C1orf50Q9BV19 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
C1orf50Q9BV19 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf50Q9BV19 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf50Q9BV19 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf50Q9BV19 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf50Q9BV19 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf50Q9BV19 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf50Q9BV19 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf50Q9BV19 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf50Q9BV19 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf50Q9BV19 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf50Q9BV19 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf50Q9BV19 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf50Q9BV19 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf50Q9BV19 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf50Q9BV19 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf50Q9BV19 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf50Q9BV19 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms