Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms