Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms