Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms