Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms