Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms