Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms