Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms