Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EP400Q96L91 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms