Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms