Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms