Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms