Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCANQ96GW7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BCANQ96GW7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms