Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms