Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUB2Q96DC9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUB2Q96DC9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms