Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP4CQ96CF2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP4CQ96CF2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP4CQ96CF2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP4CQ96CF2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP4CQ96CF2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP4CQ96CF2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP4CQ96CF2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP4CQ96CF2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP4CQ96CF2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP4CQ96CF2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP4CQ96CF2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP4CQ96CF2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP4CQ96CF2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP4CQ96CF2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP4CQ96CF2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP4CQ96CF2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP4CQ96CF2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP4CQ96CF2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP4CQ96CF2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP4CQ96CF2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP4CQ96CF2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP4CQ96CF2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP4CQ96CF2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP4CQ96CF2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP4CQ96CF2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP4CQ96CF2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP4CQ96CF2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP4CQ96CF2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP4CQ96CF2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP4CQ96CF2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP4CQ96CF2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP4CQ96CF2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP4CQ96CF2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms