Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFKQ969G6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms