Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms