Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMTQ93088 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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