Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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