Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms