Protein–RNA interactions for Protein: Q92738

USP6NL, USP6 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6NLQ92738 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP6NLQ92738 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms