Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms