Protein–RNA interactions for Protein: Q92618

ZNF516, Zinc finger protein 516, humanhuman

Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF516Q92618 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF516Q92618 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNF516Q92618 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNF516Q92618 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF516Q92618 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF516Q92618 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF516Q92618 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF516Q92618 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF516Q92618 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF516Q92618 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF516Q92618 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF516Q92618 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF516Q92618 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF516Q92618 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF516Q92618 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms