Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms