Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW33

GTSF1, Gametocyte-specific factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTSF1Q8WW33 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GTSF1Q8WW33 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms