Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCAF4Q8WV16 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms