Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC38.59■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.59■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC38.57■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.57■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC38.57■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC38.57■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
RB1CC1Q8TDY2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.56■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC38.53■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
RB1CC1Q8TDY2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms