Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms