Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COLGALT1Q8NBJ5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COLGALT1Q8NBJ5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COLGALT1Q8NBJ5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COLGALT1Q8NBJ5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COLGALT1Q8NBJ5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COLGALT1Q8NBJ5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COLGALT1Q8NBJ5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COLGALT1Q8NBJ5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
COLGALT1Q8NBJ5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COLGALT1Q8NBJ5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COLGALT1Q8NBJ5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COLGALT1Q8NBJ5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COLGALT1Q8NBJ5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COLGALT1Q8NBJ5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COLGALT1Q8NBJ5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COLGALT1Q8NBJ5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms