Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DTX3Q8N9I9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms