Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC155Q8N6L0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC155Q8N6L0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC155Q8N6L0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC155Q8N6L0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC155Q8N6L0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms