Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms