Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC84Q86UT8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC84Q86UT8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC84Q86UT8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC84Q86UT8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC84Q86UT8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC84Q86UT8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC84Q86UT8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC84Q86UT8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms