Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms