Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms