Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms